Fluorescenčná in situ hybridizácia
Fluorescenčná in situ hybridizácia (FISH) je jednou z niekoľkých techník, ktoré sa používajú na vyhľadávanie DNA vašich buniek a hľadajú prítomnosť alebo neprítomnosť špecifických génov alebo častí génov.
Mnoho rôznych druhov rakoviny je spojených so známymi genetickými abnormalitami. A genetickým, nie sme len hovorili o dedičnosti. Počas celého života môžu bunky robiť chyby, keď sa delia a rastú.
Mutácie v DNA, ktoré sú spojené s rakovinou, sa môžu v týchto bunkách akumulovať.
Ako funguje FISH?
FISH je technika, ktorá používa fluorescenčné sondy na detekciu špecifických génov alebo častí génov (sekvencie DNA). Pracovníci laboratória zdravotníckeho centra a onkológovia používajú FISH na posúdenie pacientov, ktorí môžu mať rakovinu, a niekedy na monitorovanie pacienta, u ktorého už bol diagnostikovaný rakovina a liečený.
FISH sa môže robiť s použitím rôznych typov vzoriek podľa miesta a druhu rakoviny, ktorá je podozrivá: nádorové bunky získané z periférnej krvi, biopsie kostnej drene alebo z biopsie lymfatických uzlín a tkanivo s pevným parafínom fixovaným formalínom (to znamená vzorka tkaniva, ktorá sa spracováva v laboratóriu a zapracuje sa do typu vosku, čím sa stáva tuhším, takže môže byť nakrájaný na tenké časti a namontovaný na pohľade pod mikroskopom.
Čo znamenajú písmená?
"H" vo FISH znamená hybridizáciu.
Pri molekulárnej hybridizácii sa ako sonda použije značená DNA alebo RNA sekvencia - ak si to budete predstavovať, predstavte si červenú tehlu Lego. Sonda sa použije na nájdenie náprotivnej Lego tehly alebo DNA sekvencie v biologickej vzorke.
DNA vo vašom exempláre je ako hromady kociek Lego a väčšina tehál v týchto hromadách sa nezhoduje s našou červenou sondou.
A všetky vaše tehly sú úhľadne usporiadané do 23 párov tehlových pilót - každá hromada je jeden z vašich párových homológnych chromozómov, viac či menej. Na rozdiel od Lego tehál, naša červená Lego sonda je ako silný magnet a nájde svoj zápas bez toho, aby musel triediť cez hromady.
"F" sa týka fluorescencie. Naša červená sonda sa môže stratiť v hromadách tehál, takže je označená farebným fluorescenčným farbivom, takže bude žiariť. Keď nájde svoju zhodu medzi 23 spárovanými hromadami, značka fluorescencie odhalí jeho polohu. Takže teraz môžete vidieť, ako môžu výskumníci a klinickí pracovníci používať FISH, aby pomohli identifikovať, kde (kde hromada, alebo ktorý chromozóm) je daný jednotlivý gén umiestnený.
"I" a "S" sú in situ . To sa týka skutočnosti, že naša červená kocka Lego hľadá svoj zápas v rámci vzorky, ktorú ste dali .
Čo konkrétne s rakovinou krvi?
FISH a iné in situ hybridizačné postupy sa používajú na diagnostiku rôznych chromozomálnych abnormalít - zmien v genetickom materiáli, zmien v chromozómoch vrátane nasledujúcich:
Vymazanie - časť chromozómu je preč
Translokácia - časť jedného chromozómu sa rozpadne a prilepí sa na iný chromozóm
Inverzia - časť chromozómu sa rozpadne a opäť sa vloží späť, ale v opačnom poradí
Duplikácia - časť chromozómu je prítomná v príliš veľa kópiách v bunke
Každý typ rakoviny môže mať vlastnú sadu chromozomálnych zmien a príslušné sondy. FISH nielen pomáha identifikovať počiatočné genetické zmeny v procese ochorenia, ako je rakovina, ale môže byť tiež použitý na sledovanie odpovede na liečbu a odpustenie choroby.
Genetické zmeny, ktoré zistil FISH, niekedy poskytujú dodatočné informácie o tom, ako sa rakovina jedinca pravdepodobne bude správať, na základe toho, čo sa v minulosti pozorovalo u ľudí s rovnakým druhom rakoviny a podobných genetických zmien. Niekedy sa FISH používa už po diagnostikovaní, aby získal ďalšie informácie, ktoré by mohli pomôcť predpovedať výsledok pacienta alebo najlepšiu liečbu.
FISH dokáže identifikovať chromozomálne abnormality v leukémii vrátane chronickej lymfocytovej leukémie (CLL). Pri chronickej lymfocytovej leukémii / malom lymfocytickom lymfóme umožňuje FISH pacientovi zistiť svoju prognostickú kategóriu: dobrá, stredná alebo slabá. Pri akútnej lymfoblastickej leukémii (ALL) môže genetika leukemických buniek povedať o úrovni rizika rakoviny a pomôcť riadiť terapeutické rozhodnutia.
FISH panely sú tiež dostupné pre lymfóm, mnohopočetný myelóm, poruchy proliferácie plazmatických buniek a myelodysplastický syndróm. V prípade lymfómu z plášťových buniek sa napríklad vyskytuje translokácia, ktorú môže detegovať FISH nazývaný GH / CCND1 t (11; 14), ktorý je často spojený s týmto lymfómom.
Prečo FISH?
Výhodou FISH je to, že sa nemusí vykonávať na bunkách, ktoré sa aktívne delia. Cytogenetické vyšetrenie zvyčajne trvá približne tri týždne, pretože rakovinové bunky musia rásť v laboratórnych miskách asi 2 týždne predtým, než sa môžu testovať. Na rozdiel od toho výsledky FISH sú zvyčajne k dispozícii v laboratóriu počas niekoľkých dní.
> Zdroje:
> Cytogenetické testovanie kódov CPT pre rakovinu.
> Fluorescenčná in situ hybridizácia (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluorescenčná in situ hybridizácia (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD a spol. Usmernenie pre fluorescenčné in situ hybridizačné testy pri hematologických poruchách. Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2007; 9 (2): 134-143.