Ďalšie informácie o druhu druhu Paenibacillus VT 400
V lete roku 2016 sa na výročnom stretnutí Americkej spoločnosti pre mikrobiológiu stretli vedci, ktorí sa podelili a diskutovali o zisteniach týkajúcich sa sveta baktérií a ľudského zdravia.
Medzi objavmi bola skupina hlásená o celom genóme alebo kompletnom súbore génov pre baktériu s názvom kmene VT 400 (PVT400) druhu Paenibacillus. Tieto baktérie sa predtým nachádzali v slinách pediatrického pacienta s akútnou lymfoblastickou leukémiou (ALL).
Podrobné informácie z tejto a budúcich štúdií pomôžu vedcom dozvedieť sa, či tieto baktérie môžu mať úlohu v ľudských ochoreniach, najmä u ľudí s akútnou leukémiou, u ktorých sa vyvinie pneumónia alebo infekcie krvného obehu.
Pneumónia u ľudí s rakovinou
Pneumónia je hlavnou príčinou smrti u pacientov s rakovinou s neutropéniou, najmä u pacientov s akútnou leukémiou. Neutropénia je nízky počet neutrofilov v krvných neutrofiloch sú bielych krviniek, ktoré sú dôležité pri napomáhaní organizmu v boji proti infekcii .
Infekcie dolných dýchacích ciest sú veľmi časté u pacientov s rakovinou, pričom niektoré správy dokazujú, že 13 až 31 percent pacientov s leukémiou, ktorí sú liečení chemoterapiou a až 80 percent príjemcov transplantovaných krvotvorných kmeňov, bude mať aspoň jednu epizódu zápalu pľúc.
Neutropenická pneumónia je potenciálne život ohrozujúca infekcia. V takýchto prípadoch lekári okamžite začnú antibiotickú liečbu, bez toho, aby čakali na laboratórne výsledky, aby potvrdili a špecifikovali typ bakteriálnej infekcie - pretože je veľmi dôležité začať liečbu naraz, aby sa znížilo riziko, že pacient podľahne infekcii.
V určitých prípadoch sa používa preventívna liečba, ktorá je podrobne opísaná nižšie.
Nedávny pokrok v liečbe neutropenickej pneumónie vyvoláva nádej na lepšie výsledky. Viaceré lekárske spoločnosti vydali aktualizované smernice pre antibiotickú liečbu suspektnej neutropenickej pneumónie.
A je možné, že novšie látky, ktoré podporujú reakcie tela na infekciu, môžu ďalej zvyšovať aktivitu antibiotík.
Zameranie na patogény u pacientov s neutropéniou
Pokyny od Americkej spoločnosti pre klinickú onkológiu (ASCO) odporúčajú, aby sa lekári pokúsili zabrániť infekcii u ambulantných pacientov s hlbokou neutropéniou, ale bez horúčky. Antibakteriálna a antifungálna liečba sa odporúča, ak sa predpokladá, že neutrofily zostanú pod 100 / μL dlhšie ako sedem dní. V usmernení sa uvádza, že výhodným činidlom pre antibakteriálnu preventívnu liečbu je perorálny fluorochinolón, zatiaľ čo antifungálna liečba je perorálny triazol.
Pacienti s neutropéniou sú náchylní na oveľa širšiu paletu patogénov než ich protivníci. Môže byť užitočné pre lekárov, aby zvážili, odkiaľ pochádzajú baktérie, pri predpovedaní, ktoré antibiotiká pravdepodobne budú rezistentné, a preto sú s najväčšou pravdepodobnosťou najviac účinné.
Paenibacillus Druhy
S týmto cieľom vedci študovali PVT400, nové baktérie izolované z leukémiového pacienta, ktorý je členom rodu Paenibacillus - rodina tyčinkovitých bakteriálnych druhov. Rôzne druhy v tejto skupine boli izolované z pôdy, vody, rastlín, mlieka a ďalších miest.
Nie je však známe, že druhy druhu Paenibacillus spôsobujú ľudské ochorenie. kým nedávne správy nepreukázali možné zapojenie troch rôznych druhov Paenibacillus do ľudských chorôb.
Po PVT 400 bol izolovaný zo slin pediatrického pacienta s akútnou lymfoblastickou leukémiou , skoré štúdie preukázali určitú podobnosť týchto izolátov s druhmi amylolyticus, ktorý sa nachádza v larvej zadnej časti miechy; k dnešnému dňu je stále pravdou, že P. amylolyticus nebol zistený u ľudí a ďalšie štúdie ukázali rozdiely medzi baktériou kmeňa VT 400, ktorá sa našla u pacienta s rakovinou a iných P.
amylolyticus.
Takže keď vyšetrovatelia študovali celý genóm VT 400, bolo tu množstvo zaujímavých zistení. Mali gény kódujúce mechanizmy rezistencie na chemoterapeutické lieky, ako je tunikamycín a bleomycín. Tiež našli gény pre bakteriálne pumpy spojené s multidrogovou rezistenciou, ako aj gény kódujúce rezistenciu na antibiotiká, vrátane vankomycínu, fosmidomycínu, tetracyklínu, ako aj liekov podobných penicilínu alebo beta-laktámov.
Autori tejto genómovej štúdie poznamenali, že kompletná genómová sekvencia Paenibacillus sp. kmeň VT 400 pomôže určiť úlohu druhov Paenibacillus pri chorobách ľudí a poskytne prehľad o zložení normálnych baktérií žijúcich u pacientov s rakovinou krvi.
zdroj:
> Evans SE, Ost DE. Pneumónia u pacientov s rakovinou s neutropéniou. Curr Opin Pulm Med . 2015; 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H, et al. Kompletná genómová sekvencia Paenibacillus polymyxa kmeňa SB3-1, pôdna baktéria s antagonistickou aktivitou voči rastlinným patogénom. Genóm Announc . 2015, 3 (2): e00052-15.
De Souza R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, et al. Genóm Pseudomonas sp. FeS53a, predpokladaná baktéria podporujúca rast rastlín, spojená s ryžou pestovanou v pôdach so železnou pôdou. Genóm Announc. 2015, (2): e00248-15. 10,1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P, Hornitzky M a kol. Dohľad nad včelstiev na Novom Zélande na Paenibacillus alvei. NZ Entomol . 2013; 36: 82-86.
Kim KK, Lee KC, Yu H a spol. Paenibacillus sputi sp. nov., izolovaný zo sputa pacienta s pľúcnym ochorením. Int J. Syst Evol Microbiol . 2010; 60: 2371-2376.
Mulcahy N. Nové usmernenie ASCO o neutropéne a horúčke. Medscape Medical News. 16. januára 2013. K dispozícii na adrese http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
Flowers CR, Seidenfeld J, Bow EJ a kol. Antimikrobiálna profylaxia a ambulantná liečba horúčky a neutropénie u dospelých liečených na malignitu: usmernenie klinickej praxe American Society of Clinical Oncology . J Clin Oncol . 2013; 31 (6): 794-810.